学院坚持“四个面向”，紧紧围绕国家中长期发展战略和区域重大需求，按照“自主创新，重点跨越，支撑发展，引领未来”的方针，扎实推进科研战略迭代升级，努力实现“总量、内涵、声誉”协同发展。

1999年-2021年，科研总经费累计达26.39亿元。承担千万元级科研项目32项，其中担任首席科学家主持“973”计划项目3项、重大科学研究计划项目1项，主持国家重点研发计划项目4项，科技支撑计划项目4项，转基因生物新品种培育重大专项11项，农业部公益性行业科研专项6项。获国家自然科学基金资助项目879项，其中重点项目、重点国际合作项目、区创基金重点支持项目37项，国家杰出青年科学基金10项，优秀青年科学基金项目10项。以第一完成单位获省部级以上奖项110项，其中获国家自然科学二等奖2项，国家科技进步二等奖3项，省部级一等奖33项，此外还参与获得国家奖11项。以第一单位获主要农作物品种国家审定5个、省级审定54个，非主要农作物品种国家登记21个、省级审（认）定22个，植物新品种权16个，农业部农药认证1个；获授权国际专利9项，国家发明专利801项，实用新型专利等69项；获国家标准4项，行业标准5项，省级地方标准9项。发表SCI收录论文5500余篇，出版著作200多本，其中在Science上以第一完成单位发表论文1篇、合作发表论文3篇，在Nature上以第一完成单位和共同第一作者发表论文各1篇，在Cell上以第一完成单位发表论文1篇，在Nature Genetics 上以第一完成单位发表论文2篇，在Nature Plants、Nature Communications、PNAS、Plant Cell等高水平期刊上发表论文多篇。

 学院建有国家重点实验室（共建）1个、国家地方联合工程实验室1个、农业农村部重点实验室4个、浙江省重点实验室4个、浙江省工程实验室2个、科技部国际科技合作基地1个、高等学校学科创新引智计划基地2个、浙江省国际科技合作基地3个；拥有国家自然科学基金委创新研究群体1个、教育部长江学者和创新团队发展计划3个、科技部创新人才推进计划重点领域创新团队1个、农业部科研杰出人才及其创新团队5个、浙江省重点科技创新团队5个、浙江省领军型创新创业团队1个。（数据截止2022年9月15日）